不動の滝を過ぎるとすぐ右手に山門あり、この山門をくぐると、右手に鐘楼、その先に本堂、本堂の左手に元三大師堂、この元三大師堂の先に深大寺の北門、深大寺北門を通過するとすぐに神代植物公園の入口になる深大寺門がある。