サザンテラス改札口は平成１８年４月１６日より開設された。ここからJR新宿駅の下記のプラットフォームへ進むことが出来る。

１・２：埼京線、湘南新宿ライン
３・４：湘南新宿ライン、成田エキスプレス、東武線直通
５・６：中央本線（特急）
８・１０：中央線快速
１１：中央・総武線（各駅）
１２：山手線、渋谷・品川方向
１３：山手線、池袋・田端・上野方向
１４：中央・総武線各駅、大久保・中野・三鷹方向